Podatnicy VAT muszą przed dniem wykonania pierwszej operacji podlegającej opodatkowaniu oddać naczelnikowi swojego urzędu skarbowego zgłoszenie rejestracyjne. Podatnik, który myśli, żeby realizować wewnątrzwspólnotową dostawę bądź też nabycie, jeszcze przed pierwszą czynnością musi zawiadomić o takim zamiarze naczelnika urzędu skarbowego, który to zarejestruje go wtedy jako podatnika VAT UE. Podatnik taki otrzymuje NIP, który musi umieszczać na fakturach oraz ofertach. Podatnicy muszą obliczać i wpłacać podatki co miesiąc do 25. dnia miesiąca. Suma sumarum więc miesięczne obliczanie podatku to nic innego jak konfrontacja dwóch rodzajów faktur, które występują u podmiotu gospodarczego w konkretnym miesiącu– faktur dostarczanych podatnikowi oraz wystawianych przez niego. Specjalne organy podatkowe dostają deklarację, chyba że określą ją w inaczej. W podatku od towarów i usług stosowana jest więc procedura samoobliczania podatkowego. W przypadku złego naliczenia podatku w zgłoszeniu– naczelnik urzędu celnego decyduje o podatku w prawidłowej wysokości.